En période de reproduction, le Pyrargue fréquente à la fois les côtes rocheuses et les bords des fleuves, ainsi que les plans d’eau. Il est plutôt inféodé aux milieux aquatiques.
Il fait son nid aussi bien sur des arbres que sur des falaises, voire à même le sol.
En hivernage en France, il se rencontre principalement dans les grandes zones humides peu dérangées et riches en nourriture.
